律师在起草协议时，其收费主要依据几个关键因素。
一是协议的复杂程度，简单的协议，其条款相对清晰明了，涉及的法律关系较为单一，这样的协议收费大概在1000元到3000元左右。
而较为复杂的协议，像涉及重大财产权益的，或者包含多方法律关系的，收费就会高一些，通常在5000元至1万元，甚至可能更高。
另外，所需时间也是一个因素，若协议需要进行大量的法律研究，以确保其合法性和合规性，以及进行谈判协商等工作，那么收费也会相应增加。
不同地区的律师收费标准存在差异，经济发达地区由于成本较高、法律市场竞争等原因，收费相对会比较高。
所以，在委托律师起草协议时，一定要与律师充分协商，确定具体的收费标准，并且签订委托合同，把双方的权利义务以及收费事宜都明确下来，这样可以避免后续可能出现的纠纷。