1.当夫妻双方都愿意离婚时，孩子抚养权的归属主要有以下这些方面需要考虑：
关于孩子的年龄问题：一般来说，孩子在两岁以下的时候，通常会跟随母亲生活。
这是因为这个阶段的孩子更需要母亲的照顾和关爱，母亲能给予他们更细腻的呵护。
父母的经济状况：如果一方能够为孩子提供更优质的生活条件，比如更好的居住环境、更充足的物质资源等，那么这一方在争取孩子抚养权时就更有优势。
父母的抚养能力和抚养条件：其中包括能够花费多少时间和精力去照顾孩子，是否有足够的耐心和细心等。
比如，一方工作比较灵活，有更多的时间陪伴孩子，这对争取抚养权就很有帮助。
孩子的意愿：当孩子达到八周岁以上时，他们已经有了一定的认知和判断能力，此时就需要尊重他们的真实意愿。
孩子更倾向于跟随哪一方生活，法院也会在判决时予以考虑。
2.通常情况下，如果夫妻双方的条件大致相当，那么法院会依据“有利于子女身心健康，保障子女的合法权益”这一重要原则来做出判决。
举例来说，如果母亲患有久治不愈的传染性疾病或者其他严重疾病，这种情况下孩子继续与母亲共同生活可能会对他们的身体健康造成不利影响，那么父亲就更有可能获得孩子的抚养权。
3.夫妻双方还可以在离婚协议中明确约定孩子的抚养权归属以及相关的事宜，只要这些约定没有违反法律的规定，一般都会得到法院的认可。
这样可以避免在离婚后因为孩子抚养权问题产生不必要的纠纷和矛盾，让离婚过程更加平稳和顺利。

案情回顾:

小朱和小李夫妻双方都愿意离婚，但在孩子抚养权归属上产生争议。孩子三岁，小朱经济条件好但工作忙，小李工作灵活但收入一般。双方都想争取孩子抚养权。

案情分析:

1、孩子三岁超过两岁，年龄因素上没有绝对倾向于某一方的判定。
2、小朱经济状况较好，能提供更优质物质条件，在这方面有一定优势；但小李工作灵活，有更多时间陪伴孩子，在抚养时间和精力上占优。
3、因孩子未达八周岁，无需考虑孩子意愿。综合来看，法院可能会依据“有利于子女身心健康，保障子女合法权益”原则，倾向于将抚养权判给小李。若双方能在离婚协议中明确约定且不违法，法院会认可。