具体原因是：
一、商品房属于国有土地，没有土地证，可以在房产证下来后到土地资源局自己办理相关的《国有土地使用权证》。
二、农村自建房所占用的土地属于集体土地，只有集体的土地证，并且只有使用权，没有所有权。

《民法典》第二百零九条
不动产物权的设立、变更、转让和消灭，经依法登记，发生效力；
未经登记，不发生效力，但是法律另有规定的除外。
依法属于国家所有的自然资源，所有权可以不登记。