独资公司有着其独特的股权结构特点，不存在所谓的股份分配问题。
在独资公司中，全部的股份都集中在出资人一人手中，这意味着出资人对公司拥有绝对的控制权。
当出资人希望对公司的权益等方面进行安排时，他可以选择通过签订协议的方式来明确各方在公司运营以及收益分配等各个方面的权利和义务。
这里的协议并非是传统意义上那种单纯的“股份分配”协议。
这种协议的签订，是出资人根据自身的意愿和公司的实际情况，对公司内部权益关系进行调整的一种方式。
然而，需要特别注意的是，这种协议的效力以及相关的法律后果并不是固定不变的，而是需要根据具体的情况以及协议的具体内容来进行确定。
如果协议的内容违反了法律法规或者公司章程等相关规定，那么就有可能导致该协议无效，甚至可能引发法律纠纷。
总之，一般情况下，独资公司不会进行股份分配式的操作，而是通过这种特定的协议等方式来对公司内部的权益关系进行调整，以适应公司发展的需要和出资人自身的意愿。

案情回顾:

小朱设立了一家独资公司，后想对公司权益进行安排，便与小李签订协议，明确双方在公司运营及收益分配等方面权利义务。但小胡认为此协议违反公司章程，引发争议，协议效力成焦点。

案情分析:

1、独资公司股份集中于出资人小朱手中，其有控制权，通过协议安排公司权益是可行方式，但协议需符合规定。
2、小胡提出协议违反公司章程，若属实，根据相关法律，该协议可能无效，因协议效力需依据具体情况和内容确定，违反规定会引发法律纠纷。