检察院自侦案件的办案程序：
1.人民检察院对于报案、控告、举报和自首的材料，按照管辖范围，迅速进行审查，认为有犯罪事实需要追究刑事责任的时候，予以立案。
2.人民检察院依法进行侦查，收集、调取犯罪嫌疑人有罪或无罪、罪轻或罪重的证据材料。
3.侦查终结后，作出提起公诉、不起诉或者撤销案件的决定。

《刑事诉讼法》第一百六十七条
人民检察院对直接受理的案件中被拘留的人，认为需要逮捕的，应当在十四日以内作出决定。
在特殊情况下，决定逮捕的时间可以延长一日至三日。
对不需要逮捕的，应当立即释放；
对需要继续侦查，并且符合取保候审、监视居住条件的，依法取保候审或者监视居住。
第一百六十八条
人民检察院侦查终结的案件，应当作出提起公诉、不起诉或者撤销案件的决定。