若在强奸犯罪案件审理过程中，被告方未表示认同指控，那么这可能导致司法人员在裁决定罪及量刑时，将其不认罪的行为作为考量因素之一，进而倾向于给予更为严厉的判罚。
因为在司法实践中，认罪悔过往往被视作减轻刑罚的重要依据之一。
而被告方的不认罪态度，有可能让司法人员认为被告方并没有充分意识到自身所犯下的罪行及其带来的后果，且未能展现出足够的忏悔之心。

《中华人民共和国刑法》第六十七条
【自首】犯罪以后自动投案，如实供述自己的罪行的，是自首。对于自首的犯罪分子，可以从轻或者减轻处罚。其中，犯罪较轻的，可以免除处罚。
被采取强制措施的犯罪嫌疑人、被告人和正在服刑的罪犯，如实供述司法机关还未掌握的本人其他罪行的，以自首论。
犯罪嫌疑人虽不具有前两款规定的自首情节，但是如实供述自己罪行的，可以从轻处罚；因其如实供述自己罪行，避免特别严重后果发生的，可以减轻处罚。