检察院免于起诉和不起诉有区别。
两者适用的条件和性质不同，免予起诉一词在刑事诉讼法修改后已不再使用。
根据法律规定，不起诉是指人民检察院对公安机关移送起诉的案件和自行侦查终结的案件，经审查认为犯罪嫌疑人不构成犯罪或者依法不应追究其刑事责任，从而作出的不向人民法院起诉的一种决定。

《刑事诉讼法》第十六条
有下列情形之一的，不追究刑事责任，已经追究的，应当撤销案件，或者不起诉，或者终止审理，或者宣告无罪：
（一）情节显著轻微、危害不大，不认为是犯罪的；
（二）犯罪已过追诉时效期限的；
（三）经特赦令免除刑罚的；
（四）依照刑法告诉才处理的犯罪，没有告诉或者撤回告诉的；
（五）犯罪嫌疑人、被告人死亡的；
（六）其他法律规定免予追究刑事责任的。