在债务人公司进行破产后清偿阶段，雇员保护条款中所规定的赔偿金额的计算方法，主要是根据每个雇员的具体工作经验以及他们所获得的工资等级而定。
通常情况下，雇主会按照受雇于同一家企业的每位雇员的工作年限，每达到一个完整年份就向他们提供一个月薪水作为经济补偿的基准。
如果雇员的服务期超过了六个月但不足以达到一整年，那么将被视为一整年的工作时间来计算；
如果雇员的服务期低于六个月，则只会得到半个月薪水的经济补偿。
此外，如果雇员的月工资水平超过了雇主所在的直辖市或设有行政区划的市级人民政府公布的该地区上一年度职工月平均工资的三倍，那么向他们支付经济补偿的标准将按照职工月平均工资三倍的数额来执行，并且向他们支付经济补偿的最长年限不得超过十二年。

《中华人民共和国劳动合同法》第四十七条
经济补偿按劳动者在本单位工作的年限，每满一年支付一个月工资的标准向劳动者支付。六个月以上不满一年的，按一年计算；不满六个月的，向劳动者支付半个月工资的经济补偿。
劳动者月工资高于用人单位所在直辖市、设区的市级人民政府公布的本地区上年度职工月平均工资三倍的，向其支付经济补偿的标准按职工月平均工资三倍的数额支付，向其支付经济补偿的年限最高不超过十二年。
本条所称月工资是指劳动者在劳动合同解除或者终止前十二个月的平均工资。