1.用人单位垫付情况：一般而言，在工伤发生后，医疗费用通常由用人单位先行垫付。
这是因为用人单位对员工在工作过程中的安全负有一定责任。
当员工因工作原因受伤，用人单位有义务及时为其支付医疗费用，确保员工能得到及时有效的治疗。
2.职工自行垫付情况：若用人单位因各种原因未能及时垫付工伤医疗费用，工伤职工可先自行垫付。
这样能保证治疗不被延误。
3.申请报销流程：之后，工伤职工需通过工伤认定程序，向社保经办机构申请报销医疗费用。
报销时，要准备好相关医疗费用凭证，如病历、发票、检查报告等材料，以便社保经办机构审核。
4.特殊申请情况：若用人单位未按规定申请工伤认定，工伤职工可在事故伤害发生之日或者被诊断、鉴定为职业病之日起1年内，直接向用人单位所在地统筹地区社会保险行政部门提出工伤认定申请。
总之，工伤医疗费用原则上由用人单位承担，职工可依规报销或申请认定。

案情回顾:

小郑在工作时受伤，用人单位小李公司起初未及时垫付医疗费用，小郑只好自行垫付。之后小郑准备申请报销，却因部分病历材料缺失与社保经办机构产生争议，且小李公司也未按规定申请工伤认定。

案情分析:

1、小李公司作为用人单位，对员工工作安全负有责任，未及时垫付医疗费用违反相关规定。
2、小郑自行垫付保证了治疗不被延误，后续申请报销时应按要求补齐相关医疗费用凭证，以便社保经办机构审核。
3、因小李公司未按规定申请工伤认定，小郑有权在规定时间内直接向用人单位所在地统筹地区社会保险行政部门提出工伤认定申请。