当商铺主体变更过程中出现问题，首先需要深入了解并定义所面临的具体问题。
这其中可能包括变更程序未能严格依照法律规定执行，或者涉及到合同条款中的争议，甚至是相关各方之间的权利和义务界定不够明晰。
针对程序方面的问题，我们需要审查变更行为是否符合相关的法律法规以及行政规定，比如是否已经完成了必须的登记手续、备案工作等等。
若是涉及到合同争议，则应该根据签订的合同条款来评估各方的权利和义务。
倘若合同条款表述模糊，可以参照行业惯例和公正原则进行处理。
在此基础上，将所有与此次变更相关的证据收集整理好，包括但不限于合同文件、通信记录、交易凭证等等，以备将来如有需要，可以通过协商、调解或诉讼等手段解决相关争议。
我们建议阁下先行详细梳理问题的各个细微之处，以便更为精准地制定相应的应对策略。