首先，我们得清楚这5000元民事纠纷的具体案由究竟是什么，像是借款纠纷、买卖合同纠纷或者侵权纠纷等等。
倘若属于借款纠纷这一情况，出借人要是能够拿出借款凭证，像借条之类的东西，并且在没有特别的抗辩理由的前提下，法院一般都会作出判决，让借款人把5000元的借款本金给偿还了。
这是因为借款凭证是证明借款事实存在的重要依据，有了它，法院就能依据相关法律规定来进行公正的裁决。
要是碰到的是买卖合同纠纷，卖方已经按照约定履行了交货的义务，同时又有确凿的证据能够证明买方没有支付那5000元的货款，那么法院通常会判定买方必须支付这笔货款。
这是为了维护市场交易的公平和秩序，确保卖方的合法权益得到保障。
而对于侵权纠纷来说，原告要是能够充分证明被告的侵权行为给自身造成了5000元的损失，并且被告在这其中存在过错，法院就有可能判决被告赔偿原告5000元的损失。
法院的判决其实就是基于双方所提交的各种证据，对事情的真实情况进行认定，然后再根据适用的相关法律法规来确定责任到底该归属于哪一方。
这样才能保证每一个民事纠纷的处理都有法可依、公正合理。