倘若亲子抚养监护权纠纷案经法院判决后已经启动了执行程序然而却未能寻觅到被申请人踪迹，那么此类情况下，法院会根据具体情形运用各种手段来确保执行。
例如，法院有可能借助先进的网络技术，通过在线搜索及监控系统以获取被执行人的财富状况；
此外，院方可依据实情向相关行政机关发送协助执行通知，请求其协助寻找被执行人的行踪。
与此同时，作为案件当事人的您亦可主动向法院提供关于被执行人可能藏匿地点的有效线索，以便于法院更高效地推进执行工作。

《中华人民共和国民事诉讼法》第二百五十三条
被执行人未按执行通知履行法律文书确定的义务，人民法院有权向有关单位查询被执行人的存款、债券、股票、基金份额等财产情况。人民法院有权根据不同情形扣押、冻结、划拨、变价被执行人的财产。人民法院查询、扣押、冻结、划拨、变价的财产不得超出被执行人应当履行义务的范围。
人民法院决定扣押、冻结、划拨、变价财产，应当作出裁定，并发出协助执行通知书，有关单位必须办理。