在分居满两年的情况下办理离婚手续，法律规定主要存在以下两种途径。
首先，若男女双方对离婚相关事宜能够达成共识，则可按照协议离婚程序进行操作，即双方需签署离婚协议书，并亲自前往婚姻登记机关提出离婚申请，待经过离婚冷静期之后，方能领取离婚证书。
其次，若男女双方未能就离婚事宜达成一致意见，便需要通过诉讼离婚流程解决争议，具体步骤是依法向法院提交离婚诉讼请求，由法官依据实际情形判决是否允许离婚。
通常来说，法院在审理离婚案件过程中，若判定当事人因分居已经满两年且夫妻关系确实已经破裂，在符合其他法定条件的情况下，将会做出准许离婚的裁决。

《中华人民共和国民法典》第一千零七十九条
夫妻一方要求离婚的，可以由有关组织进行调解或者直接向人民法院提起离婚诉讼。
人民法院审理离婚案件，应当进行调解；如果感情确已破裂，调解无效的，应当准予离婚。
有下列情形之一，调解无效的，应当准予离婚：
（一）重婚或者与他人同居；
（二）实施家庭暴力或者虐待、遗弃家庭成员；
（三）有赌博、吸毒等恶习屡教不改；
（四）因感情不和分居满二年；
（五）其他导致夫妻感情破裂的情形。
一方被宣告失踪，另一方提起离婚诉讼的，应当准予离婚。
经人民法院判决不准离婚后，双方又分居满一年，一方再次提起离婚诉讼的，应当准予离婚。