在针对分居状态下办理离婚证明书这一情况进行探讨时，首要且关键的步骤便是明确，夫妻双方究竟是倾向于选择协商和平地解除婚姻关系，亦或是选择提交法庭裁决解决争议。
若是前者，那么双方必须就子女抚养事宜达成共识，与此同时，还须做好离婚协议等必要文件的准备工作，最后共同前往婚姻注册机构递交离婚申请。
在经历了相关法律所规定的冷静期之后，便可顺利领取正式的离婚证书。
但若选择后者，即通过法院判决离婚，同样也需要由法庭来决定孩子的确切抚养安排。
在这个过程中，必须要充分考虑小家伙的年龄、以及对比当前双方的实际抚养能力与条件等诸多因素，努力争取为孩子谋求最大的益处。

《中华人民共和国民法典》第一千零八十四条
父母与子女间的关系，不因父母离婚而消除。离婚后，子女无论由父或者母直接抚养，仍是父母双方的子女。
离婚后，父母对于子女仍有抚养、教育、保护的权利和义务。
离婚后，不满两周岁的子女，以由母亲直接抚养为原则。已满两周岁的子女，父母双方对抚养问题协议不成的，由人民法院根据双方的具体情况，按照最有利于未成年子女的原则判决。子女已满八周岁的，应当尊重其真实意愿。