关于商铺租赁合同纠纷的妥善处理方式，主要包括以下几种途径:
首先是当事人双方进行友好协商；
其次，也可尝试通过法律调停来化解矛盾；
再次，若无法协商解决问题，还可选择向相关的仲裁机构提出仲裁请求；
最后，倘若以上途径均行不通，则可依据相关法律规定向当地人民法院提起诉讼。在实际中，若租赁关系产生纠纷且双方签订了仲裁协议，则可以直接按照合同条款约定的仲裁管辖地提交仲裁申请，以期解决争议。
然而，对于那些不愿意接受调解或者对调解结果不满，同时又未能就仲裁事项达成共识的租赁纠纷，当事人有权依法向人民法院提起诉讼。

《中华人民共和国民事诉讼法》第九十九条调解达成协议，必须双方自愿，不得强迫。调解协议的内容不得违反法律规定。《中华人民共和国民事诉讼法》第一百二十二条起诉必须符合下列条件：(一)原告是与本案有直接利害关系的公民、法人和其他组织;(二)有明确的被告;(三)有具体的诉讼请求和事实、理由;(四)属于人民法院受理民事诉讼的范围和受诉人民法院管辖。