一家年收益达一亿元人民币的公司在缴纳税款方面，应按照其总营业额的百分之二十五进行计算，即1亿元乘以25%的比例，得到最终的税款金额为2500万元。这即是我国内资企业及经营单位因生产经营活动和其他方面的盈余所应交纳的税收类别之一——企业所得税。

《中华人民共和国个人所得税法》第十二条纳税人取得经营所得，按年计算个人所得税，由纳税人在月度或者季度终了后十五日内向税务机关报送纳税申报表，并预缴税款;在取得所得的次年三月三十一日前办理汇算清缴。纳税人取得利息、股息、红利所得，财产租赁所得，财产转让所得和偶然所得，按月或者按次计算个人所得税，有扣缴义务人的，由扣缴义务人按月或者按次代扣代缴税款。