当机动车发生事故且承担次要责任时，保险赔偿的计算方式通常是依据责任比例来进行的。
一般情况下，次要责任需要承担30%的赔偿责任。
首先，交强险会在其责任限额范围内对对方的人身伤亡以及财产损失进行赔偿。
当交强险完成赔偿之后，剩余的损失部分会由商业三者险按照30%的比例来进行赔偿。
举例来说，倘若对方的损失总共是10万元，而交强险的赔偿限额是12.2万元，其中包含2000元的财产损失。
那么，交强险会全额赔偿这10万元。
要是对方的损失超过了交强险的赔偿限额，超出的那部分金额的30%就会由商业三者险来进行赔偿。
与此同时，自身车辆的损失也可以依据保险合同，通过交强险和商业险来获得相应的赔偿，不过同样也是按照责任比例来计算的。
总而言之，在机动车发生事故并承担次要责任时，保险赔偿的流程是首先查看交强险的赔偿情况，然后再看商业险的赔偿情况，并且都是按照责任比例来进行赔付的。
这样的赔偿方式能够较为合理地分摊事故损失，保障各方的利益。

案情回顾:

小朱驾驶机动车与小李发生碰撞事故，小朱承担次要责任。小李损失达20万元，小朱车辆也有损失。双方就保险赔偿计算方式产生争议，小李认为小朱应按自己计算的金额赔偿，小朱觉得应按保险规定赔偿。

案情分析:

1、按照规定，交强险先在限额内赔偿，限额内可赔小李12.2万。
2、超出交强险部分7.8万，商业三者险按小朱承担30%责任，即赔偿2.34万。小朱车辆损失也按保险合同和责任比例获赔。所以赔偿应按规定流程和比例计算。