倘若房屋抵押协议被判定为无效条款，那么阁下可以按如下步骤试图取回属于自己的房产权证。
首个方案是尝试与抵押权人进行平等和解商议，明确提出请求将抵押行为予以解除，进而归还己方的房产证。
若是协商无果，建议阁下采取司法途径解决问题，向当地法院提交请求，申请对上述抵押行为的有效性给予司法确认，同时要求抵押权人终止抵押行为，返还房产证给相关业主。
在司法诉讼期间，阁下有必要提供相关证据以证实该项新的房屋抵押行为无效的具体原因，例如抵押行为尚未按照法律规定履行相应登记程序，或者存在恶意欺骗或者威胁恐吓等不当情形。

《中华人民共和国民法典》第四百零二条
以本法第三百九十五条第一款第一项至第三项规定的财产或者第五项规定的正在建造的建筑物抵押的，应当办理抵押登记。抵押权自登记时设立。