手机上交农村合作医疗需要当地医保部门推出相关缴纳渠道才行，比如手机app、微信公众号、官网等，具体要咨询当地的相关部门。农村合作医疗保险费一般是在当年年末缴纳第二年度的费用，如果错过缴纳时间，第二年就无法继续享受农村合作医疗保障。

《中华人民共和国社会保险法》第二条
国家建立基本养老保险、基本医疗保险、工伤保险、失业保险、生育保险等社会保险制度，保障公民在年老、疾病、工伤、失业、生育等情况下依法从国家和社会获得物质帮助的权利。