房屋买卖合同纠纷案件中，确实可以通过协商的方式约定进行仲裁处理。仲裁作为一种纠纷解决机制，其优势在于程序灵活、保密性高以及裁决结果权威等方面。只要是在双方当事人意愿一致且彼此明确同意的情况下，通过订立仲裁协议来选择以仲裁途径来解决争议，都是被法律所允许和认可的。然而，值得注意的是，仲裁协议中所约定的仲裁机构必须是明确而唯一的，否则将会被认定为无效的仲裁协议。根据我国《仲裁法》第四条的相关规定，当当事人选择以仲裁方式解决纠纷时，必须是基于双方自愿的原则，并且已经就仲裁协议达成了共识。如果缺乏有效的仲裁协议，那么任何一方单独提出的仲裁请求，都将不会得到仲裁委员会的受理。

《仲裁法》第四条当事人采用仲裁方式解决纠纷，应当双方自愿，达成仲裁协议。
没有仲裁协议，一方申请仲裁的，仲裁委员会不予受理。