关于被羁押后拒绝承认罪行并选择不接受惩罚的案件在法庭上作出最终裁决，需综合全面审查案件所涉及的全部证据质量及其实际状况来加以裁定。
如若案件所载之证据确凿无误且充分有力，足以充分证实被告确有罪行，即便被告拒绝承认罪行和选择不愿意接受惩罚，法院仍有权依法对其作出有罪判决。
在司法实践的过程中，对于那些拒不承认罪行但选择不愿意接受惩罚的被告，法院可能会在判决徒刑时选择性地不考虑减轻处罚的因素。
然而，对于被告是否真正构成犯罪以及应当判处何种程度的刑罚，仍然必须严格按照法律规定及审判所认定的事实做出理性判断。

《中华人民共和国刑事诉讼法》第五十五条
【重证据、重调查研究、不轻信口供原则】对一切案件的判处都要重证据，重调查研究，不轻信口供。只有被告人供述，没有其他证据的，不能认定被告人有罪和处以刑罚；没有被告人供述，证据确实、充分的，可以认定被告人有罪和处以刑罚。
证据确实、充分，应当符合以下条件：
（一）定罪量刑的事实都有证据证明；
（二）据以定案的证据均经法定程序查证属实；
（三）综合全案证据，对所认定事实已排除合理怀疑。