农村房屋违章建筑的处理方式，一般有以下几种情况：
一、责令限期拆除
当相关执法部门通过调查、核实等一系列严谨的程序，认定某农村房屋属于违章建筑后，会正式下达责令限期拆除决定书。
这份决定书会明确告知当事人具体的拆除期限，要求其在规定时间内自行完成拆除工作。
之所以这样做，是希望给予当事人主动纠错的机会。
如果当事人能够在期限内积极配合，自行拆除违章建筑，那么就可以有效减少后续可能面临的法律风险，比如避免因拒不执行而受到更严厉的处罚，同时也能降低因强制拆除可能带来的经济损失，比如减少拆除过程中对建筑内物品的损坏等。
二、强制拆除
当事人在规定期限届满后，依然没有自行拆除违章建筑，执法部门为了维护法律法规的严肃性和公共利益，就会依法进行强制拆除。
在实施强制拆除之前，执法部门通常会按照法定程序进行催告和公告。
催告是提醒当事人履行拆除义务，公告则是向社会公示相关信息，确保程序的公正性和透明度。
三、罚款并补办手续
在某些特定情形下，对于符合一定条件的违章建筑，比如因历史遗留问题或者对规划影响较小等，执法部门会允许当事人在缴纳相应罚款后，补办相关的建设审批手续，从而使该建筑合法化。
具体的处理方式会综合考虑违章建筑的形成原因、对规划的影响等多方面因素来确定。
若当事人对处理决定不服，有权依法申请行政复议或提起行政诉讼。

案情回顾:

小朱在农村私自搭建房屋，被执法部门认定为违章建筑，下达责令限期拆除决定书，要求其15日内拆除。小朱却认为自家建房是历史遗留问题不应拆除，未按要求拆除。执法部门催告公告后拟强制拆除，小朱对此不服。

案情分析:

1、执法部门认定小朱房屋为违章建筑并下达限期拆除决定书，程序合法。给予小朱自行拆除期限，是保障其纠错机会。
2、小朱以历史遗留问题为由不拆除缺乏依据，执法部门催告公告后进行强制拆除，是维护法律严肃性和公共利益的必要举措。
3、若小朱对处理决定不服，有权依法申请行政复议或提起行政诉讼。