双方签订的协议即便不进行公证，也是有效的。
以下为您详细分析：
一、协议生效的一般条件
依据我国《民法典》的相关规定，依法成立的合同，自成立时便生效，不过法律另有规定或者当事人另有约定的情况除外。
具体来说，协议要想有效，需要满足多个条件。
首先，协议必须是双方真实意思的体现。
这意味着双方在签订协议时，是出于自愿、真实的意愿，不存在欺诈、胁迫等违背自身意愿的情形。
其次，协议内容不能违反法律法规的强制性规定，也不能违背公序良俗。
比如，不能签订涉及违法犯罪活动或者严重违背社会公德的协议。
同时，签订协议的双方还需要具备相应的民事行为能力，能够对自己的行为及其后果承担相应的法律责任。
只有同时满足这些条件，协议才具有法律效力。
二、公证的作用
公证并非协议生效的必要程序。
公证的主要作用在于增强协议的证据效力和公信力。
在诉讼过程中，经过公证的协议通常会被法院直接采信，其证明力相对较高。
因为公证机构会对协议的真实性、合法性进行严格审查。
然而，即便协议没有经过公证，只要它符合生效条件，同样会受到法律的保护。
综上所述，双方签订的协议即使不公证，只要满足法定生效条件，就是有效的。

案情回顾:

小朱与小李签订了一份合作协议，未进行公证。后小朱认为未公证协议无效，欲终止合作，小李则认为协议有效，双方产生争议。

案情分析:

1、从协议生效一般条件看，若小朱和小李签订协议时是真实意思表示，不存在欺诈、胁迫等情形，比如对合作事项是充分协商且真心认可的，那么在这一点上协议是有效的。
2、协议内容若未违反法律法规强制性规定和公序良俗，且双方具备相应民事行为能力，即使未公证，依据相关法律规定，该协议也具有法律效力，应受法律保护。