剥夺政治权利的执行机关有两种：
1.由监狱管理机关执行。刑法规定剥夺政治权利的效力，施用于主刑执行期间。在主刑执行期间，监狱管理机关依照刑法的规定，施行对其剥夺政治权利的处罚。
2.由公安机关执行。被判处管制拘役的罪犯，是交由公安机关执行其主刑的，其附加剥夺政治权利，也应由公安机关执行。

《中华人民共和国刑法》第五十八条
附加剥夺政治权利的刑期，从徒刑、拘役执行完毕之日或者从假释之日起计算；剥夺政治权利的效力当然施用于主刑执行期间。
被剥夺政治权利的犯罪分子，在执行期间，应当遵守法律、行政法规和国务院公安部门有关监督管理的规定，服从监督；不得行使本法第五十四条规定的各项权利。