非法运输林木立案标准在相关司法解释中有明确规定，即非法收购、运输明知是盗伐、滥伐的林木，涉嫌下列情形之一的，应予立案追诉：
(一)非法收购、运输盗伐、滥伐的林木二十立方米以上或者幼树一千株以上的；
(二)其他情节严重的情形。

《中华人民共和国刑法》第三百四十五条
【盗伐林木罪】盗伐森林或者其他林木，数量较大的，处三年以下有期徒刑、拘役或者管制，并处或者单处罚金；
数量巨大的，处三年以上七年以下有期徒刑，并处罚金；
数量特别巨大的，处七年以上有期徒刑，并处罚金。
【滥伐林木罪】违反森林法的规定，滥伐森林或者其他林木，数量较大的，处三年以下有期徒刑、拘役或者管制，并处或者单处罚金；
数量巨大的，处三年以上七年以下有期徒刑，并处罚金。
【非法收购、运输盗伐、滥伐的林木罪】非法收购、运输明知是盗伐、滥伐的林木，情节严重的，处三年以下有期徒刑、拘役或者管制，并处或者单处罚金；
情节特别严重的，处三年以上七年以下有期徒刑，并处罚金。
盗伐、滥伐国家级自然保护区内的森林或者其他林木的，从重处罚。