宅基地纠纷的处理程序：
1、协商解决：
《土地管理法》第16条第1款规定：
土地所有权和使用权争议，由当事人协商解决。
据此规定，公民之间发生的宅基地纠纷，应当先通过协商的方式加以解决。
2、行政解决：
《土地管理法》第16条第2款规定：
个人之间，个人与单位之间争议，由乡级人民政府或者县级以上人民政府处理。
该法还规定，侵犯土地的所有权或者使用权争议，由县级以上地方人民政府土地管理部门责令停止侵犯、赔偿损失。
3、司法解决：
《土地管理法》第16条第3款规定：
当事人对有关人民政府的处理决定不服的，可以在接到处理决定通知之日起30日内，向人民法院起诉。
先经过有关行政机关的处理，对于处理决定不服，才可以向人民法院提起诉讼。
4、此外，宅基地纠纷还可以通过人民调解来解决。

《土地管理法》第十六条
下级土地利用总体规划应当依据上一级土地利用总体规划编制。
地方各级人民政府编制的土地利用总体规划中的建设用地总量不得超过上一级土地利用总体规划确定的控制指标，耕地保有量不得低于上一级土地利用总体规划确定的控制指标。
省、自治区、直辖市人民政府编制的土地利用总体规划，应当确保本行政区域内耕地总量不减少。