两人私下写的房产协议有效。
具有法律效力的合同一般要满足三个条件：
1，签订合同的行为人应该具有相应的民事行为能力。
2，合同内容为双方真实意图的表达。
3，不违反法律和社会公共利益。因此，无论是否私下签署，只要协议满足了这三项条件就在当事人之间产生了不可撤销的特定权利和义务关系。

《中华人民共和国民法典》一百四十三条具备下列条件的民事法律行为有效：（一）行为人具有相应的民事行为能力；（二）意思表示真实；（三）不违反法律、行政法规的强制性规定，不违背公序良俗。