通常而言，在交通事故中，当双方签订了互不追究责任的协议后，一般是不能再进行起诉的。
这是因为此协议表明双方针对事故责任以及后续的赔偿等事宜，已经达成了一致的处理看法。
然而，倘若在签订协议的过程中，存在着重大误解、明显的显失公平或者欺诈等情况，那么受害方就能够在特定的期限内，向人民法院申请撤销该协议。
一旦撤销成功，受害方依然可以就事故所带来的相关损失提起诉讼。
另外，还有一种情况，倘若协议中所约定的赔偿范围，与受害方实际所遭受的损失相比，明显是不足以进行弥补的，那么受害方也有很大可能在法定的时效期间内，起诉要求对方补充赔偿。
总而言之，是否能够再次进行起诉，必须依据具体签订的协议内容以及实际的情况来进行准确的判断。
不能一概而论地认为签订了互不追究责任协议就绝对不能起诉，而要综合各种因素来确定。

案情回顾:

小朱与小李发生交通事故，事后双方签订互不追究责任协议。但之后小朱认为签订协议时存在重大误解，且协议赔偿远不足以弥补自身实际损失，遂打算起诉小李要求补充赔偿，双方就小朱能否起诉产生争议。

案情分析:

1、若小朱能证明签订协议时存在重大误解、显失公平或欺诈等情形，可在特定期限内向法院申请撤销协议，撤销成功后就能就事故损失起诉。
2、若协议赔偿范围明显不足以弥补小朱实际损失，小朱在法定时效期间内，也有可能起诉要求小李补充赔偿，具体需结合实际判断。