关于协议变更孩子抚养权的有效性问题，在符合法定条件的情况下是被认可的，下面为你详细分析：
一、符合法定情形是关键
双方协商一致是基础，同时变更抚养权必须有利于子女身心健康以及保障其合法权益。
比如，抚养方出现一些特殊情况导致无法继续抚养孩子。
像患上严重疾病，身体状况不佳，没有足够的精力和能力照顾子女；或者因伤残而丧失了劳动能力，经济上无法为孩子提供稳定的生活保障等。
又或者抚养方不尽抚养义务，对孩子的生活、学习不管不顾，甚至存在虐待子女的恶劣行为。
在这些情况下，双方签订的变更抚养权协议是有效的。
二、尊重子女意愿不容忽视
当子女已满八周岁时，他们已经有了一定的认知和判断能力，此时应当充分尊重其真实意愿。
在变更抚养权的过程中，要认真听取孩子的想法和意见，确保变更后的抚养安排是符合孩子内心期望的。
三、办理相关手续很重要
即便协议本身有效，为增强其法律效力，建议通过公证或者向法院申请司法确认的方式。
这样做的好处是，如果之后一方反悔不履行协议，另一方就可以依据经过司法确认的协议或者法院判决，要求对方履行变更抚养权的义务，从而更好地保障变更抚养权协议的顺利执行。

案情回顾:

小朱和小李原协议约定孩子抚养权归小朱，但后来小朱患上严重疾病，身体欠佳，无法照顾孩子。双方协商变更抚养权给小李，可小朱后来反悔，认为协议无效，争议焦点在于此变更抚养权协议是否有效。

案情分析:

1、从法定情形看，小朱患病无法照顾孩子，属于出现特殊情况导致无法继续抚养，且变更有利于孩子身心健康和保障其权益，所以双方协商一致的变更协议是有效的。
2、关于子女意愿，若孩子未满八周岁可不考虑；若已满八周岁，变更时需尊重其真实意愿。此案件中若孩子未满八岁，不影响协议效力。
3、若双方办理了公证或司法确认手续，协议法律效力更强。即便小朱反悔，小李可依据相关手续要求其履行协议。