法院查封房产的法定程序是：
1、法院向国土房产部门发出《协助执行通知书》及附带的法律文书；
2、办案人员向国土房产部门出示法院工作证，并分下列不同情形办理查封手续：
（1）被查封的标的物已核发房地产证的，应提交国土房产局档案室出具的查册表；
（2）被查封的标的物是预售商品房的，应提交房地产交易所出具的该预售商品房的交易情况表或该楼盘的明细表；
（3）被查封的标的物是土地的，应先到国土房产局档案室查清该土地权属情况，并提交查册的书面结果。
3、国土房产部门根据法院提交的资料，进行查封处理。
《最高人民法院关于适用<中华人民共和国民事诉讼法>若干问题的意见》
第108条 人民法院裁定采取财产保全措施后，除作出保全裁定的人民法院自行解除和其上级人民法院决定解除外，在财产保全期限内，任何单位都不得解除保全措施。