通过司法程序进行的房地产拍卖交易过程中，有可能牵涉到一些复杂的债务纠纷问题。当债务人未能按照约定的期限履行其债务义务，或者在双方协议中所规定的实现抵押权的必要条件已经满足时，债权人便有权优先获得房屋拍卖所得款项的偿还；
然而，倘若拍卖所得的收益不足以全额清偿债务，这就可能导致债务人和抵押权人之间产生新的纠纷和争议。

《民法典》第四百一十条债务人不履行到期债务或者发生当事人约定的实现抵押权的情形，抵押权人可以与抵押人协议以抵押财产折价或者以拍卖、变卖该抵押财产所得的价款优先受偿。协议损害其他债权人利益的，其他债权人可以请求人民法院撤销该协议。抵押权人与抵押人未就抵押权实现方式达成协议的，抵押权人可以请求人民法院拍卖、变卖抵押财产。抵押财产折价或者变卖的，应当参照市场价格。