在性质上存在以下区别:
首先，抗税罪的主体资格为特定主体，其仅限于那些对缴纳赋税或者负责代扣代缴、代收代缴税款负有直接责任的团体或个体;
与之对应的是，妨害公务罪的实施者涵盖了一般性的主体，即，具备行为能力且达到刑事责任年龄的自然人皆可成为该罪名的承载者。
其次，从主观动机来看，抗税罪的意图在于通过逃避税收手段获得不正当收益，而妨害公务罪的目的聚焦于阻止国家工作人员依法履行职责。
再次，两个罪行所涉的犯罪客体有所不同。
抗税罪所触犯的是国家的税收管制体系，而妨害公务罪所侵犯的则是国家机构的公共事务运行机制。
最后，关于犯罪标的物的范围，抗税罪针对的是从事税收监管作业的税务人员，而妨害公务罪侵犯的是正在履行公职的全部国家工作人员群体，覆盖面更广。

《刑法》第二百零二条
以暴力、威胁方法拒不缴纳税款的，处三年以下有期徒刑或者拘役，并处拒缴税款一倍以上五倍以下罚金;情节严重的，处三年以上七年以下有期徒刑，并处拒缴税款一倍以上五倍以下罚金。