婚内财产协议存在部分无效的情况时，并不会对其他部分的效力产生影响。
倘若协议里面仅仅有一条内容与法律规定相抵触，或者违背了公序良俗等，从而导致该条内容无效，然而其他的条款要是符合法律规定的话，依然是有效的。
比如说，在协议当中，关于某一个特定财产的处分约定是无效的，但是对于其他财产的约定却仍然可以按照约定去履行。
这其中的具体情形需要依据协议的整体内容以及相关的法律规定来进行综合的考量和判断。
倘若对于具体的婚内财产协议是否存在部分无效的情况存在疑惑，那么最好是咨询专业的律师，通过专业律师的分析和解读，能够获取到准确的法律意见，从而更好地维护自身的合法权益。