非公司制企业比如合伙企业，办理营业执照注销时需要同时将印章交予工商部门，而公司制企业注销印章是销掉公司印章的法律效应，印章可以自己保留或自行销毁。
同时，在未注销公章前，各单位要对公章进行严格管理，适用公章还需要得到领导人的批准，而不是随意使用。

《国务院关于国家行政机关和企业、事业单位印章的规定》四
（一）制发印章的机关，对印章的刻制和发送必须加强管理，严格手续。刻制印章的工厂或刻字社，必须取得用章单位的上级委托书和公安部门的准许，才能刻制。对伪造印章和使用伪造印章者，应当依法惩处。
（二）各单位对印章要严格管理，使用印章，必须经本单位领导人批准。对非法使用印章的，应当根据情节给予行政处分直至依法惩处。
（三）各单位的印章，如因机构变动停止使用时，应当将原印章缴回制发机关封存或销毁。
五、过去有关印章的规定，如与本规定不一致的，以本规定为准。