外资公司在进行股权转让时需要遵循以下流程:
1.首先，需要向批准设立该外资企业的政府部门提交股权变更申请并获得批准;
2.在获得政府部门的批准之后，需前往原注册登记机关进行变更登记的申请;
3.向原注册登记机关提交以下文件资料以供审批:
申报审批机关出具的相关文件以及其他相关信息和材料;
4.如符合规定，即可成功办理股权变更登记。
国务院批复同意生效的《外商投资企业股权变更的若干规定》第七条明文规定，外资企业投资者的股权变更由批准设立该企业的政府审批部门负责审批。
若中外合资或合作项目中的中方投资者因股权变更导致企业转为外资性质，且该企业所属行业属于《外资法规细则》第五条所明确限定的外资禁入领域，那么这种情况就必须得到中华人民共和国对外贸易经济合作部的批准。

《外资细则》第五条所规定的限制设立外资企业的行业，则该企业中方投资者的股权变更必须经中华人民共和国对外贸易经济合作部（以下简称外经贸部）批准。