在主动认罪并接受惩罚之后，仍然有权提出申诉。
认罪认罚制度旨在鼓励犯罪嫌疑人、被告人自愿且诚实地陈述自己的罪行，承认控告方指控的犯罪事实，同时也愿意接受法律所规定的相应惩罚。
尽管如此，申诉这种公民的基本权利依然不受影响。
当事人在面临认罪认罚的境况时，如果坚持认为法院的判决或裁定在对事实的认定或法律的适用方面存在明显的错误，或是存在违反法定程序等问题，那么他们完全有资格依法进行申诉。

《中华人民共和国刑事诉讼法》第二百五十二条
【申诉的提出】当事人及其法定代理人、近亲属，对已经发生法律效力的判决、裁定，可以向人民法院或者人民检察院提出申诉，但是不能停止判决、裁定的执行。