当婚姻证书遭配偶擅自保管时，仍然有权利提出离婚诉讼。
倘若不能提供已领取的结婚证书，您可前往当地的婚姻登记机构申请开具相关证明文件以支持离婚起诉。
进行离婚诉讼之前，需准备好起诉书正本及副本各两份以及原告本人的身份证件、结婚证书等相关实体证据，然后向被告目前所在地的司法机关提起诉讼。
若被告现居地址与其惯常居住地有所差异，则必须前往其惯常居住地的人民法院提起诉讼。
符合起诉要求的案件，司法机关须于七日内启动立案程序并书面通知各方当事人;
如不符合起诉要求，司法机关应在七天内作出裁决，宣布不予受理该案;
对于裁决结果不满的原告方，有权依法发起上诉。

《民法典》第一千零七十九条
夫妻一方要求离婚的，可以由有关组织进行调解或者直接向人民法院提起离婚诉讼。
人民法院审理离婚案件，应当进行调解；如果感情确已破裂，调解无效的，应当准予离婚。
有下列情形之一，调解无效的，应当准予离婚：
（一）重婚或者与他人同居；
（二）实施家庭暴力或者虐待、遗弃家庭成员；
（三）有赌博、吸毒等恶习屡教不改；
（四）因感情不和分居满二年；
（五）其他导致夫妻感情破裂的情形。一方被宣告失踪，另一方提起离婚诉讼的，应当准予离婚。