集资诈骗罪通常是由具有经济犯罪侦查权限的部门进行管辖。
这类部门被称为“经侦”，其主要职责就是对涉及各类经济犯罪活动的案件展开调查与侦破。
对于集资诈骗这种涉及到严重经济问题的恶性犯罪来说，由于具有典型性及代表性，一般也都是由此类具有专门调查能力的经侦部门进行审理。
然而，在特定的情况下，例如多个部门参与，或者多个犯罪行为交叉等情况，有时还需要刑侦部门介入进行协同处理。
具体的管辖权限则要依据案情的具体性质以及当地公安机关内部各职能部门的分工来做最终决定。

《中华人民共和国刑事诉讼法》第十九条
【职能管辖】刑事案件的侦查由公安机关进行，法律另有规定的除外。
人民检察院在对诉讼活动实行法律监督中发现的司法工作人员利用职权实施的非法拘禁、刑讯逼供、非法搜查等侵犯公民权利、损害司法公正的犯罪，可以由人民检察院立案侦查。对于公安机关管辖的国家机关工作人员利用职权实施的重大犯罪案件，需要由人民检察院直接受理的时候，经省级以上人民检察院决定，可以由人民检察院立案侦查。
自诉案件，由人民法院直接受理。